传统OA的优势在于打破信息孤岛、应用孤岛和资源孤岛，帮助企业实现电子化、自动化和无纸化办公；劣势主要表现为系统建设投入成本高、实施周期长、定制开发难度大、失败的风险高。相对于传统OA办公系统，云OA 的优势在于：
1 云OA办公系统对用户自身的硬件和网络运维要求较低，方便部署。通过云OA，用户可以将文件直接存放在云中进行共享、协同，并且用户可以自行建立和管理云文件库，随时随地都能进行访问和工作，不再束缚于传统OA对硬件和地域的限制。
2 有别于传统OA办公系统固化于企业内部的形式，云OA提供基于用户的实际需求与并发数的动态差异化功能，并可依照用户量动态分配资源，以多租户架构将OA云延伸至新单位、合作伙伴、甚至客户。
3 云OA的投入成本风险相对较小。云OA提供试用尝试，用户也可以根据自己的需求自由更换应用；使用费用可以按年或按月支付，并且用户不用承担维护成本。而传统的OA办公系统，虽然也提供软件试用，但不支持可以根据用户的需求随时对软件进行自定义更改；软件的投入成本从几万到几十万不等，用户还要承担系统维护成本和软件实施失败的风险。
但云OA也有其先天的劣势，就是用户数据的安全问题。也是目前说云OA的多，实际应用少的原因。如果用户的数据安全问题不能解决，云OA的普及应用也难以打开局面。但这不能表明云OA未来不能取代传统OA办公系统。
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