由于微耕机工作的环境较恶劣，保养就显得尤为重要。微耕机在工作中，由于零部件互相摩檫震动，油、泥、水的侵袭，不可避免的要造成零部件的磨损；连接松动，腐蚀老化。从而使微耕机技术状态变坏，功率下降，油耗增加，磨损加快，故障不断出现。为了防止上述情况的发生，就需要严格执行“防重于治，养重于修”的维护保养制度。
微耕机在作业完后，要及时进行必要的紧固和部件调整，微耕机很多地方使用一段时间后，有些零件的间隙会增大，都要用户自己进行必要的调整。部分微耕机的离合器、倒档、油门、转向等都是通过拉线操作的，而拉线又容易变形拉长，所以要通过调整螺丝及时进行调整。还有齿轮转动箱的一轴、二轴，两对锥形齿轮等使用一段时间后，会产生一定的间隙，一轴、二轴通过紧后端螺丝进行调整，两队锥形齿轮通过增加钢垫片来调整。
微耕机使用完后，及时调整维修它的各个零部件，从而延长它的使用寿命，提高它的工作效率！