1 系统功能细化不足
就目前来说，市面上存在的OA系统其功能都已经很全面了，涉及到用户的各方面的应用。但这只是一个表象，用户在实际的操作使用中更多的会应用到每一个功能的细分，比如发送一个通知能不能收到自动回执、工作流的跳转等。这些深层次的应用能否实现是影响软件实施成功的一个重要因素。
2 系统使用上手困难
一方面是用户方面的原因，计算机基础、熟练程度不同；另一方面是则是各厂商的原因。软件不容易使用是很多人排斥软的一个重要原因。功能全面但使用不便也是影响后期实施的因素。
3 系统功能不够实用
系统越做越大，内容越来越多，是现在OA办公系统的一个特点，并且有很多功能就是一个摆设。受到成本的影响，用户一般不会选择再开发，只是用一些基本的功能。没有发挥OA应有的功能。
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